Ao longo de seis anos (1999 a 2005) dezenas de trabalhos científicos foram realizados no Parque do Zizo, que mantém um alojamento especial para pesquisadores.
Algumas descobertas importantes se ressaltam, como a confirmação através da observação do Mono-carvoeiro ou Muriqui Brachyteles aracnoides, o maior primata das Américas, endêmico da mata atlântica e presente na lista de animais ameaçados de extinção do IBAMA.
Outros projetos nacionais também já passaram pelo Parque do Zizo, tal como exemplo o Projeto Cervídeos Brasileiros, que executou um programa para localização e identificação do veado-bororo, espécie rara encontrada apenas no Parque Estadual Intervales.
Importantes pesquisadores já visitaram o Parque do Zizo como o botânico Hanrry Lorenzi, que visitou o parque em 2002, outro botânico que passou pelo parque foi o Engenheiro Agronômo Rogério Salviani, que identificou importantes palmeiras desse bioma, como a ica Lhitocarium hoehneii e a guaricanga Geonoma gamiova e G. escotiana.
Hoje uma das maiores preocupações do parque é a preservação do palmito-juçara (Euterpe edulis) , planta ameaçada de extinção pelo seu corte ilegal. O Palmiteiro-juçara é uma importante fonte de alimento para a fauna local, pois muitas aves alimentam-se do seu coquinho como tucano, araçaris, jacutinga, jacu, araponga, sabiá, maritacas e papagaios, assim como também alguns mamíferos, exemplo a paca, anta, veado, macaco-prego, mono-carvoeiro, assim ajudando a dispersar sua semente na floresta e ajudando na manutenção de sua população.

	Levantamento de mamíferos e sua caça em uma área preservada de Mata Atlântica na Serra de Paranapiacaba, Sudeste de São Paulo
	Pesquisadora: Camila Pianca Orientadores: Dr. Paulo Inácio Prado e Dra. Lúcia Ferreira da Costa Projeto Floresta e Mar – "Usos e Conflitos no Vale do Ribeira" NEPAM - Núcleo de Estudos e Pesquisas Ambientais PUC – SP :. :.html
	Dados preliminares sobre o estudo de epífitas (Bromeliaceae, Orchidaceae e Cactaceae) que ocorrem na Reserva Parque do Zizo – São Miguel Arcanjo, São Paulo
	Pesquisadora: Valeria Braga França Orientadora: Profª Cibele Cardoso Castro Co-Orientadora: Profª Aparecida Cardoso Universidade: Centro Universitário Nossa Senhora do Patrocínio – CEUNSP relatorio.pdf:. .Lista de Epífitas:.pdf
	Inventário: Os anfíbios anuros do Parque do Zizo
	Pesquisador: Lucas Rodriguez Forti Orientador: Prof. Dr. Luciano Mendes Castanho Universidade: PUC-SP (Pontifícia Universidade Católica) Relatorio do Inventário :.pdf
	Uso de um recurso natural por populações humanas e seus efeitos sobre a biodiversidade: caça de mamíferos no Vale do Ribeira - Relatório de conclusão, 2004
	:.html Pesquisadora: Camila Câmara Pianca Universidade: Escola Superior de Agricultura Luiz de Queiroz – Esalq - USP
	Árvores presentes no Parque do Zizo,
	levantamento feito por Thiago Conforti. 2001... :.PDF
	Espécies da fauna de répteis de ocorrência confirmada no Parque do Zizo
	Pianca & Fogaça, 2003; Castanho, 2005):.html